Le portefeuille d'un FCPI est composé à hauteur de 60% (minimum) de PME à caractère innovant et non cotées, tandis que les 40% restants sont placés dans d'autres types d'actifs. Ces investissements étant par nature risqués, ils font l'objet d'une défiscalisation de 25% instaurée par l'Etat, afin de rendre ce type d'investissement plus attractif. 

L'objectif est d'obtenir une plus-value à l'issue de la durée de blocage des fonds (de cinq à dix ans).